Bueno, esta técnica se la puede aplicar tanto para cambiar el color de ojos como para el cabello, hasta incluso la ropa, todo dependiendo de la habilidad y la práctica. En este caso la aplicaré para cambiar el color de los ojos.

Para emprezar, abrimos la imagen a la que queremos cambiarle el color, utilizaré esta:
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Ahora, la duplicamos arrastrandola hacia el ícono de nueva capa o bien Mayús.+Ctrl+N

Precionamos Ctrl+U para colorizar la nueva capa y colocamos éstos valores:

Claro que los valores son unicamente ilustrativos, cada uno puede cambiarlos para obtener el color deseado.
Con la capa colorizada seleccionada vamos a:

Veremos que la imagen volvío a su apariencia original, pero en la paleta de capas se añadió la utilidad de máscara (pantallita negra).

Ahora lo único que debemos hacer es ir descubriendo poco a poco las partes que necesitamos que cambien de color, para eso verificamos que los colores frontal y de fondo sean negro y blanco respectivamente, para estar seguros presionamos D. Escogemos un pincel de bordes difumindado para empezar a pintar.

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Al final nos quedará el ojo pintado.

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Para las áreas pequeñas, utilizaremos pinceles de menor diámetro de forma que podamos pintar solamente el iris. Luego cambiamos el modo de fusión de la capa. En este paso, dependiendo del color que se esté utilizando, la utilización de los distintos modos de fusión darán distintos resultados, para este caso utilizaremos el modo Trama.



Resultado:

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